Diagnóstico laboratorial: E. coli (Diarreia)

Testes disponíveis

Cultivo bacteriano

• Isolamento de organismos vivos
• Tipo de amostra: fezes, conteúdo intestinal.
• Prós:
  • As bactérias são fáceis de crescer em 1 dia
  • Fácil de fazer em qualquer laboratório (mesmo interno).
  • Custo relativamente baixo.
• Contras:
  • Algumas E. coli formam parte da flora intestinal normal.
  • Os suínos tem várias E. coli ao mesmo tempo.

  • Se os suínos forem previamente tratados com antibióticos, isso pode prevenir o crescimento bacteriano.

Susceptibilidade antimicrobiana (antibiograma)

• Teste in vitro: capacidade de um organismo vivo de crescer sob concentrações específicas de diferentes antimicrobianos.
• Tipo de amostra: fezes, conteúdo intestinal.
• Prós:
  • Identificação de suscetibilidade ou resistência de cepas específicas a antimicrobianos comuns.
  • Identificação de tendências de resistência antimicrobiana.
• Contras:
  • Requer um isolado bacteriano.
  • Os testes in vitro podem diferir ligeiramente dos resultados in vivo.
  • Alguns antimicrobianos específicos podem não ser incluídos ou exigir testes especiais separados.
  • Custo moderado.

Histopatologia

• Avalia a presença de lesões de tecido (dano) que podem confirmar a presença de doença. Às vezes, a presença de organismos também pode ser detectada diretamente (bactérias e parasitas) ou indiretamente (vírus) usando colorações especiais adicionais.
• Tipo de amostra: tecidos.
• Prós:
  • Associa adesão bacteriana com dano intestinal.
  • Nenhuma coloração especial é necessária.
• Contras:
  • Os tecidos intestinais precisam de fixação com formalina dentro de 15 minutos após a morte do animal. O tecido intestinal se decompõe rapidamente.
  • A doença pode ser segmentar, portanto, várias amostras intestinais devem ser enviadas.

Genotipagem

• Técnica de PCR (reação em cadeia da polimerase), que detecta a presença de uma sequência específica de ácidos nucléicos (DNA) associada a genes de virulência conhecidos.
• Prós:
  • Realizado por PCR; fácil de fazer.
  • Ajuda a identificar a patogenicidade detectando a presença de genes (não necessariamente expressão gênica) associados a fatores de virulência.
    • Genes de toxinas: EAST1, LT, STa, STb, Stx1, Stx2, Stx2e.
    • Genes de Pilus: F18, F41, K88 (F4), K99 (F5), 987P (F6).
    • Genes de Adesinas: AIDA, EAEA, PAA.
  • Facilita a seleção adequada da vacina (combinando pili correto).

Genes de E. coli detectados mediante genotipificação por PCR e por sua função.

• Contras:
  • Requer isolamento bacteriano.
  • Os suínos podem ter mais de uma linhagem ao mesmo tempo, então devemos esperar ter isolado a linhagem correta..
  • Preço moderado, mas geralmente apenas uma cepa isolada é testada.

Interpretação de resultados

Cultivo bacteriano

• A interpretação da hemólise depende da idade dos animais:
  • Pré desmame: E. coli. não hemolítica
  • Pós desmame: E. coli hemolítica.
• Pureza:
  • Crescimento puro: altamente sugestivo de que contribui para a doença.
  • Crescimento misto: valor questionável.
• Quantidade:
  • Alta: altamente sugestivo de que está contribuindo com a doença.
  • Moderado: interpretação variável.
  • Baixo: valor questionável (poderia ser um contaminante).
  • Sem crescimento: Animal possivelmente tratado previamente com antibióticos para o agente, sem contribuição significativa.

Susceptibilidade antimicrobiana (antibiograma):

• Suscetível: Possível boa escolha para tratamento se o antimicrobiano puder atingir o tecido-alvo.
• Resistente: um antimicrobiano diferente deve ser selecionado.
• CIM: Se a CIM (concentração inibitória mínima) for realizada, deve-se garantir que o antimicrobiano selecionado atinja o valor da CIM indicado no órgão-alvo.

Histopatologia

• Positivo: Forte associação como causa se for capaz de demonstrar lesões intestinais com E. coli aderindo as células epiteliais.
• Negativo: Sem lesões intestinais.

Genotipagem

• A genotipagem é muito valiosa para identificar se a E. coli isolada contém algum dos fatores de virulência que dariam suporte ao isolado como patógeno.

Coleta de amostrar para análises

Suínos com diarreia (qualquer idade) :

• Colete swabs retais de 2 ou mais animais com diarreia, não tratados com antibióticos e envie-os para cultura bacteriana, antibiograma e genotipagem.
• Eutanásia 1-3 leitões com diarreia que não receberam tratamento. Colete imediatamente 3 amostras de intestino de cada leitão e coloque-as em solução de formaldeído. Colete amostras frescas de intestino para enviá-las refrigeradas para cultura bacteriológica, antibiograma e genotipagem.